Trên mảnh đất Thiếu Lâm Tự, các cao tăng thiếu lâm tiếp tục bảo vệ bí mật của môn võ bị thất truyền. Trong lúc đó, Hồng Kim Bảo, Tạ Miêu và Bào Quốc An - ba người hùng trẻ tuổi xuất hiện, sẵn sàng chiến đấu để khôi phục danh dự cho Thiếu Lâm Tự. Sứ mệnh của họ là tìm ra và tiêu diệt kẻ thù đang âm mưu phá hủy ngôi chùa linh thiêng này. Những trận đấu quyết liệt, những bí ẩn được hé lộ và những tình cảm chân thành giữa các nhân vật đã tạo nên một câu chuyện kịch tính và xúc động trong Thiếu Lâm Tự Truyền Kỳ 3.
